由于石墨坩堝具有體積密度大、耐高溫、傳熱快、耐酸堿腐蝕、高溫強度大、抗氧化功能高檔特色，因此，在運用過程中難免會用來防止腐蝕性物質。盡管石墨坩堝具有抗酸抗堿的才能，但是關于個別原料的煉制，在坩堝運用今后的收拾作業卻很費事。
    石墨坩堝的清洗首要進行的作業是將坩堝內的化學物質收拾出來，然后進行清潔，我們需求依據石墨坩堝內的剩余物質是什么來決議用什么東西來清洗，一般石墨坩堝上的附著物是無機焚燒后的殘渣，我們可以運用鹽酸來進行收拾，大多數都是可以溶的，一些含有碳成分的殘留物，運用鹽酸是不能溶解的的，這時可以運用硝酸進行清洗，由于硝酸具有強氧化性，在清洗時也可以恰當加熱。
    關于那些收拾的物質，可以在稀鹽酸或稀硝酸內煮沸注意所用的鹽酸中不得含有硝酸，硝酸鹽，鹵素等到氧化劑。假如稀硝酸尚不能洗凈時，則用焦硫酸鉀，碳酸鈉或硼砂熔熔清洗。
    石墨坩堝需求保持清潔，表里應亮光，通過持久灼燒后，坩堝表面可能黯然無光，日久必深入到內部致使坩堝脆弱破裂，因此有必要清楚不清潔之物。如仍有五點或表面發烏，則用通過100篩意圖無尖銳棱角的細砂，用水潤進行悄悄沖突，使表面回復光澤。